Для защиты озимого рапса от сорняков применяются, главным образом, химические методы защиты.
Первыми в списке стоят почвенные гербициды, защищающие от однолетних двудольных и однодольных сорняков. Это препараты на основе Метазохлора, Кломазона, Квинмерака (Бутизан Стар, Команд, Транш-супер, Султан). Обычно их применяют до всходов культуры путем опрыскивания почвы, а по отдельным гербицидам возможно применение до 2-х настоящих листьев культуры. Для борьбы с однолетними и многолетними злаковыми сорняками, в том числе и с падалицей зернового предшественника, применяются различные граминициды – препараты на основе Феноксапроп-П-этил, Хизалофоп-П-этил, Клетодим, Галоксифоп-Р-метил, Флуазифоп-П-бутил и др. Как правило, эти препараты можно вносить во всех фазах развития культуры, начиная от семядольных листьев.
Большую опасность для озимого рапса представляют двудольные сорняки, особенно из семейства капустных, к которому относится и сам рапс. Для их уничтожения применяются препараты на основе действующих веществ Клопиралид, Пиклорам, Этаметсульфурон-метил, для гибридов под КЛ технологию – имазамокс, имазапир, имазетапир. Применение гербицидов на основе этих действующих веществ регламентировано по фазе применения и обычно не покрывает весь спектр сорной растительности, а также имеет стрессовое воздействие на культурное растение.